迅速提升檢驗量能的「迷你池法」,是否可以成為擴大篩檢的助力?

我們想讓你知道的是
新的「迷你池法」可達到與一個一個個別檢驗不相上下的水準。白話就是說,傳統方法驗的出來,「迷你池法」也能驗的出來。
文:陳宏賓(UniMath,中興大學應數系)
我們的世界在2、3月發生了巨變,為了抵擋新冠病毒持續擴散,各國陸續下達封城等極端措施。從3月開始,台灣的每日確診案例也穩定的維持在1、20例上下,截至今日(4月6日)已經累計373例。民眾緊張的氣氛,也隨著近幾天找不到感染源的本土案例增加而升高。
許多人質疑目前台灣的篩檢標準是否訂得太嚴格,容易有漏網之魚;也有人建議擴大篩檢範圍,例如入境者全面篩檢之類的。
擴大篩檢要面對的至少有兩個問題:
- 檢驗量能:台灣一天最多能夠進行多少量的PCR檢驗?
- 必要性:亂槍打鳥式的檢驗如果沒有辦法有效抓到鳥,反而浪費了醫療資源。必須要知道,任何檢驗都是要成本的。
關於檢驗量能的提升,這裡要和大家分享一個好消息。前幾天德國一個專業網站healthcare-in-europe.com發佈一則新聞,節錄新聞的重點,簡單說就是德國的科學家發展出一種新的檢驗程序,可以大幅增加檢驗量能對抗新冠病毒。
整個研究團隊組成包含德國紅十字捐血中心Erhard Seifried教授的團隊,和法蘭克福大學醫院病毒醫學中心Sandra Ciesek教授的團隊。他們稱這個新方法為「迷你池法」(mini pool method)。報導指出這個方法通過由德國醫學學會(German Medical Association)認證的環形比對試驗(Ring Trial)。可以理解成這套方法經過其他醫療檢驗機構的佐證,具備可靠性和一致性。
迷你池法
原本檢驗的方法,是管子一根放一個檢體;迷你池法就是一根放好幾個檢體(德國現在是用5個)。理想狀態我們希望實驗結果若是陽性,表示這根管子的五個檢體有至少一個陽性,若是陰性則表示5個檢體都是陰性。
像這種把好幾個待測物放在一起測試的概念,有一門學問專門處理這類問題,這門學問就叫「群試理論」。群試理論最早也是發明來檢驗大量的士兵中,哪些人感染梅毒。

結果顯示,新的「迷你池法」可達到與一個一個個別檢驗不相上下的水準。白話就是說,傳統方法驗的出來,「迷你池法」也能驗的出來。
他們另外又將這套方法用在50個檢驗樣本(未經篩選過),將之分成10個迷你池,每個迷你池有五個樣本。然後對這10個迷你池做PCR驗病毒,也同時對50個樣本一一檢驗。結果裡面有五個樣本感染新冠病毒,分佈在四個迷你池中,而這四個迷你池也都正確驗出陽性。
至於其他不包含病毒樣本的迷你池,則全都是陰性反應。兩種方法的最終結果完全吻合。
這個發現為未來對抗新冠病毒帶來希望,將人類大量篩檢新冠病毒的能力提升到另一個層級——成本固定但檢驗更多人數。如此一來能更快掌握整體受感染人數的資訊,並且加以管控隔離。
以現在通過評測的方法來說,一個mini pool測五個檢體,假設以台灣目前一天檢驗800人左右來算,可直接加速到4000人。假設陽性率一樣維持在1%左右,偵測到40位感染者,最糟就分佈在40個mini pool,因此總共頂多需要40*5+800=1000個檢驗,就能夠達到4000人次的篩檢能量。效率翻了四倍,重點是PCR檢驗成本幾乎不變。
以上就是來自德國的新消息,以下有幾點要補充說明。
1. 這個「迷你池法」不是新的
早在第二次世界大戰期間,美國科學家Robert Dorfman就提出將若干樣本混合後,再進行一次檢驗的方法,跟這裡所說的「迷你池法」完全一致。當時是用來檢驗大量徵召來投入戰場的士兵,是否感染梅毒。
這個方法後來稱為「群試理論」(group testing),因應各種實際應用問題,發展出更多種不同的模型,應用在血液檢驗、分子生物或化學實驗、DNA定序以及藥物篩選。此外,也有用在工業品管和電腦科學上,例如影像壓縮、電子防盜指紋應用等等。
2. 這個方法有兩個固有的使用限制
第一,是要檢驗的物品要能夠放在一起測試,這個在PCR檢驗上應不成問題。PCR如同擴大機,只是藉由不斷的加熱降溫過程,並透過聚合酶反應讓DNA增至病毒量可被偵測。報導中提到迷你池法不會稀釋病毒的比例,這或許就是迷你池法可以和一個一個檢驗,達到相同水準的緣故。
第二,是當陽性率過高時,不適合用群試,因為並不會提高效率。看一個極端例子,如果上述50個樣本中都被感染病毒,那麼你分成迷你池就測了10次,結果10個迷你池都陽性又要再一一檢驗,最後全部花了10+50=60次,白白浪費了力氣,還不如一開始就一一檢驗。其實不用到全部,只要不到五分之一以上,就沒有太多效率上的優勢了。
3. 有爆發疑慮、但還沒爆發的地方適合用這招
利用大量篩檢來圍堵病毒,現在台灣的陽性率低,大約1%左右,所以非常適合用這招。陽性率太高不適合用,例如現在的紐約。
4. 會不會發生誤判?
依據德國研究團隊的說法,跟一個一個檢驗一樣準。換句話說,迷你池法驗不出來的,原本的一一檢驗方式也驗不出來。
5. 容錯設計
群試理論發展多年有比迷你池法更進階的設計,其中一個就是容錯設計,可以容許錯誤發生。像這種生物實驗出錯有許多可能,實驗本身或其他人為失誤,都有可能造成偽陰性或偽陽性。容錯設計就是在少量實驗結果出錯時,仍可糾正回來,這也牽涉到編碼學。
6. 同步設計
迷你池法的一個缺點,是第一輪大量篩檢後,還要經過第二輪才能確認。如果一輪檢驗耗時三天,這樣等於至少要等六天才能得知結果,多了三天到處走也提高了不少風險。
同步設計就可以避免這個問題,所有檢驗在第一輪完成,透過適當設計,只要從檢驗結果就能反推確診案例,無須進行第二輪檢驗。真的很神奇,不過這就是數學而已。
7. 群試理論還有很多特別的模型
例如應用在B型肝炎檢驗時,由於驗B肝是抽血液。若干血液混合後,除了有病毒被稀釋的疑慮要面對之外,將有B肝抗原的血液和有B肝抗體的血液混在一起,也會發生抗原抗體結合的抑制效果。造成結果顯示陰性,但實際裡面有人是陽性的誤判。這種也有其他特別的模型,提供好的解答方案。
8. 另一種模型,是一個迷你池要同時有兩個以上的被感染樣本,才會呈現陽性
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10大南投農會伴手禮【下篇】

我們想讓你知道的是
南投縣為台灣觀光首都,好山好水、景色秀麗、文化薈萃、資源豐富,而外出旅遊特色伴手禮必不可少,許多南投地區農會也推出特色伴手禮,以下為大家介紹南投10大農會伴手禮的後5項。
根據「行政院農委會」網站說明,「農會」的功用為推動農民終身學習,培育優質農業人力資源;營造農村健康生活及生產支援體系,活化鄉村社區組織。輔導農漁民團體永續經營,增進服務功能;加強國際農業合作與兩岸農業交流,擴展農業發展空間等。
農會在台灣農業生產和行銷過程中,一直扮演重要的角色。尤其是包裝、行銷地方特產,打出知名度,甚至外銷到全球,農會都是其舉足輕重的推動者。
台灣農會最知名的,就是南投信義鄉農會與其產品《馬拉桑》。《馬拉桑》是臺灣導演魏德聖執導的電影《海角七號》中,所出現的一個小米酒品牌,馬拉桑在阿美族語裡原本的意思是「喝醉了」(阿美語:Malasang)。這項產品由南投縣信義鄉農會所研發、生產,其廣告標語為「千年傳統,全新感受」。是白色甜酒,味頗像市面酵母飲料,喝多易醉。其誕生原因是2006年魏德聖為拍攝《海角七號》劇情的需要,商請南投縣信義鄉農會研發一種「有點俗、有點可愛,且具有在地感」的酒品,於是該單位以一個月的時間進行研發,推出名為「馬拉桑」的小米酒,並於前述電影上映後推出為實體商品,持續販賣至今。靠著該電影的一砲而紅,成為信義鄉著名的南投伴手禮,該項伴手禮也常賣到缺貨。
南投除了信義鄉農會,還有許多農會推出其特色伴手禮,以下為大家介紹南投10大農會伴手禮。
6. 集集鎮農會
推薦人氣伴手禮:香蕉方塊酥
集集是一典型的鄉村小鎮,東鄰水里鄉、西與名間鄉為界,南隔濁水溪與鹿谷鄉、竹山鎮為鄰、北與中寮銜接。面積以山坡地、林班地居多,平地僅佔小部分,南側為濁水溪,三面環山、山嶺重疊,濁水溪自東南西流、清水溪在北側亦東向西流向至林尾里交會濁水溪。農業部分,因集集依山傍水的地理環境,造就了其豐饒多元的農業生態,區內以山蕉、糯米荔枝及火龍果為其大宗,還有柳橙、番石榴、葡萄、山蕨、玫瑰等種植,腹地雖然不大、但因緊鄰清水溪天然無污染的山泉源頭,造就了其質優味美的農產特色。
集集生產出的香蕉香甜又彈牙,為了延續百年香蕉風華,創新並延伸香蕉產品的品項,集集鎮農會與老楊食品有限公司合作,打造出香蕉方塊酥。與方塊酥結合的香蕉粉,需要採用在地尚未成熟且黏性較低的綠香蕉,切片後烘乾研磨成粉,單純觀察或食用粉末時,可感覺其顆粒較大,係由於綠香蕉本身的纖維豐富,即使製成香蕉粉,在顆粒的口感上仍能吃出它的纖維,濃縮整根香蕉的營養,無麩質,具有天然的抗性澱粉,結合方塊酥的酥脆口感,恰好於食用時不顯突兀又爽口。
成分:香蕉方塊酥
容量:370公克
售價:159元
7. 名間鄉農會
推薦人氣伴手禮:松柏長青茶
名間鄉所生產的茶葉,無論是產量或種植面積,皆是全台第一。能有今日的成就,與當地的自然條件及茶農的處世風格,有著極為密切的關係。松柏嶺地區位居八卦山脈最南端,海拔約四百公尺的台地上,比起產製凍頂茶的鹿谷鄉,海拔高度略低,平均氣溫稍高外,其餘的條件,都極適合種茶。首先因地處山脈東面斜坡向陽處,所以一年四季日照充足,倘若又是種植四季春此多產的茶種,一年採收四次以上,是毫無問題的。又台地上處處是紅壤類的土質,適合深耕厚植茶葉。此外,四通八達的公路網,更是其他產茶鄉鎮,所欠缺的優勢。除了上述優良的自然條件外,在地茶農更保有勇於突破,精益求精的態度,亦是開創此茶葉王國的最大功臣。走訪台灣各地的茶區,很難找到一處如名間鄉般,栽植的品種,可以囊括各式的烏龍茶種,如青心烏龍、金萱、翠玉、武夷、四季春等,如此多樣性的栽種,也代表名間鄉民勇於嘗試的性格。
成分:茶葉
容量:75公克*2罐
售價:1600元
8. 南投市農會
推薦人氣伴手禮:投農米
南投市位於南投縣西北隅,貓羅溪貫穿其間,河谷溝渠縱橫,灌溉便利;溪兩側東為南投丘陵,西為八卦山台地,皆屬平坦紅壤土質,與河谷狹小平原,均肥沃適合農耕,因此農產品非常豐富。溪兩岸沖積平原盛產稻米,品質優良,為南投市知名特產之一。南投米灌溉來自濁水溪的優質水源,灌溉水質無汙染,並於產地收穀、烘乾、碾製一貫作業。南投米粒粒飽滿、晶瑩剔透,蒸煮後,散發出甘甜米香,細細咀嚼,滿滿幸福!
成分:稻米
重量:5公斤
售價:220元
9. 國姓鄉農會
推薦人氣伴手禮:國民姓福禮盒
國姓鄉山多平原少,耕作土地相當有限,農民經濟所得也相對不高。經濟產業一直以農業發展為主,多種植檳榔、枇杷、草莓、玫瑰花、香蕉、火鶴、火龍果、芭樂等等。北山茶位列本縣茶中極品;本鄉的香蕉生產為全縣第二位;而南港村則是台灣水鹿的故鄉,補中極品-鹿茸也是本鄉一大特產。初春時節,中潭公路旁的觀光草莓園,垂涎欲滴草莓,吸引遊客駐足採果購買。另外,尚有柑橘、蜜汁楊桃、芭樂、甜桃、無子檸檬、波羅蜜、蜜釋迦、香菇…等特色農特產,待遊客購買品嚐!
組合品:
.香菇 - 來自九份二山微氣候,香氣十足
.冷泉米 - 來自北港橋新豐農場的鴨禾米
.薑黃 - 有機轉型期薑黃滿五年方能採收品質保證
重量:健康菇菇、薑黃粉各50公克,冷泉米500公克
售價:2600元
10. 埔里鎮農會
推薦人氣伴手禮:玫瑰淡酒禮盒
埔里擁有得天獨厚的地理環境,四季氣候溫和及水質純淨甘美,孕育出豐盛的物產,也因此生產出名聞中外的「埔里美酒」;埔里農會特地設立酒莊於風光明媚的風景區──鯉魚潭邊,猶如世外桃源般寧靜優美,因此釀造出優質好酒。埔里農會酒莊,堅持採用代表當地水果與農特產作為原料。為了提升埔里地方農產精緻質量,讓埔里「水甜酒鄉」更加名正言順,埔里酒莊於2002年開始,引進農業改良場研發與農民契作的食用玫瑰,精心釀製的「真情玫瑰」和「玫瑰淡酒」,於2008年和2011年參加比利時布魯塞爾世界酒類評鑑,八十多國同場競爭獲得銀牌獎,為台灣農業在世界酒品市場嶄露頭角。
成分:再製酒、玫瑰花
容量:400ml*2瓶
售價:760元
以上廣告由南投縣政府農業處提供。