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GARAOTUS 台灣AI-HPC 技術領導品牌站穩亞太區十強的關鍵報導

攜手偉薩、研華及英特爾GARAOTUS助印度醫療機構提升疾病研究效能89%

2022/10/31 ,

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廣編企劃

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高效能運算(High-performance computing,HPC)在這幾年發展當中,不僅是企業創新關鍵,更是企業轉型必備要素。不過研究卻發現,企業建置HPC時花費七成時間在硬體校調,研究人員只有三成時間放在核心業務;如此不僅讓團隊花太多時間在理解軟硬體,更可能大幅延遲轉型速度。精誠集團旗下高速運算品牌GARAOTUS設計出的基因組分析解決方案,協助印度醫療機構,大幅提昇其研究所需的運算能力,共同為生醫研究領域做出貢獻。

GARAOTUS攜手偉薩科技、研華科技及英特爾,提供印度醫療機構MedGenome基因組分析整體解決方案。該解決方案整合了GARAOTUS自行研發HPC平台,CRONUS Service Fabric及CRONUS Orchestration,並搭配研華科技提供的高效能及穩定的硬體架構,以及偉薩科技提供的程式化邏輯閘陣列FPGA(Field Programmable Gate Array)結合基因定序分析的加速解決方案,有效協助MedGenome提升疾病研究效能達89%!

MedGenome是一家總部位於美國德拉瓦州的印度醫療機構,並在 2018 年獲得了生物醫學突破獎(MedTech Breakthrough Award),其生物資訊學副總裁Ravi Gupta表示:「我們的醫生和研究人員對該解決方案展現的效能及成本比印象深刻,這個解決方案為MedGenome提供並擴大了在罕見疾病和帕金森氏症,以及其他領域研究所需的運算能力。」GARAOTUS提供的基因組分析解決方案,能有效將100人的全基因組定序(Whole genome sequencing, WGS)研究時間縮短到三分之一。

隨著人體基因分析、疫苗及新藥的開發應用越來越多且複雜,研究人員需要處理與分析的流程及數據量更是多樣及多元。在缺乏視覺化、模組化與整合性的資料分析處理下.將面臨多種在資料導入及整合上的困境,更無法有效推動研究的進行。

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GARAOTUS團隊負責人薛聖傑(左一)指出:研究統計發現,企業或機構在建置HPC技術時,有將近七成的時間都花在軟硬體的校對調整,若有專業的HPC團隊助力將使企業能更專注發展核心業務。

GARAOTUS認為企業轉型需要升級,迅速導入系統是最大關鍵。「HPC目的是要把效能榨乾」,在底層的硬體必須是最新、最好,當節點已經具備一定能量,串接節能的網路、軟體也必須提升規格,光是這部分已經讓企業的IT進行升級。HPC是企業催化創新的關鍵,而HPC的基礎架構包括運算節點、網路、儲存裝置,串接起來成為一個叢集,這當中要有使用者依據經驗來執行程式,專業的軟體在伺服器上進行運作及儲存,這些都是建構產業發展與進步的基礎。

當企業內部系統的升級一切就位,即能搭配HPC技術,快速運算出想要的結果,若參數或研究模型需要調整,亦能即時快速重新進行演算,在時間及企業整體支出上,都能有效節約成本。HPC技術能夠在企業進行產品開發前協助做模擬測試,此舉不僅省去模型驗證失敗造成的資源浪費,對於提升終端使用者的體驗也是具有長遠效益。但這樣仍舊不足,這幾年隨著加入雲端服務、AI等領域,HPC亦能充份融合各種技術,擴大支援的範疇,更加符合使用者的需要。HPC是企業永續發展的支持系統,必須有專業團隊,時時監控底層介接有無潛在的問題,需要有一套穩定的機制才能協助企業升級與長期發展。

GARAOTUS提供的CRONUS平台,讓研究人員不須編寫程式,就可以運用視覺化介面以拖拉方式輕鬆進行資料分析及資訊儲存。同時,資料也能夠在組織間輕鬆的交換及協作,透過統一的平台及彈性的權限設計,讓整體流程及研究成果更易於管理,也方便研究成果重現及再利用,藉此讓非IT程式背景的研究人員,降低研究門檻,更能靈活運用研究資訊。團隊服務的最大特色就是除了能夠將流程圖像化,將原來轉譯複雜的指令,透過簡易UI取代,大幅簡化流程。以簡單的概念說明,也就是將程式語言變成一塊塊的積木,把很多個積木輸入後,進入下一個流程,就可以簡單完成一個複雜的work flow。相較於以往需要在後台打相當多的指令及拋接資料,透過GARAOTUS設計的模組,在過程中設計了一個簡化的UI介面,再丟入特定HPC進行運算即可,甚至不需資訊人員也會使用。另一方面,所有編寫紀錄都有足跡,能簡單找出每個運算結果,不僅不會因為人員交接產生斷層,也不會有重複輸入指令情形。平台會紀錄每次運算的時間與使用的資源量,這些都讓企業決策面有更好的資源分配考量。

GARAOTUS團隊負責人薛聖傑指出:「研究統計中發現,企業或機構在建置HPC技術時,有將近七成的時間都花在軟硬體的校對調整,相對的,研究人員只有三成的時間能放在核心業務。GARAOTUS平台服務的最大優勢在於,能協助完備機構所需的HPC整體系統架構建置,在介面上也降低程式指令的困難度,並轉化為視覺化的圖像。GARAOTUS在成立初期,即鎖定朝向國際發展,從過去落地台灣大型教學醫院,再來協助香港中文大學進行基因定序研究,很開心CRONUS產品也能在印度新興市場落地,為MedGenome提供HPC相關解決方案,未來GARAOTUS也將持續與國際生態圈夥伴合作,共同發展更多成功案例。」

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GARAOTUS獲美國全球企業領袖雜誌評選「2022全球前30大矚目企業」之一

CRONUS的平台優勢包括採用了HPC技術的底層架構,並向上延伸到服務層,提供了GAPaaS (Genomics-Analytics-Process-as-a-Service)的視覺化服務,未來GARAOTUS將持續攜手各領域生態圈夥伴提供服務,包括過去投入的精準醫療與大氣服務,下個階段更將著眼助攻半導體晶片的研發製程、全自動智慧製造應用,以及金融高性能計算的數值方法應用等,助力各產業與高速運算技術接軌。

GARAOTUS今(2022)年更獲得美國全球企業領袖雜誌(Global Business Leaders Magazine),評選為全球矚目的30大企業之一。報導指出,GARAOTUS 提供了具備多樣化與包容性的HPC解決方案,並涵蓋了許多開源技術的應用。多年來,團隊在開源組織社群發揮舉足輕重的作用,也曾經在2021年獲頒亞洲企業組織(Enterprise Asia)的IIA國際創新獎,是第一個因HPC 技術獲得此獎項的團隊。未來團隊將持續以HPC技術為基礎,擴展解決方案組合,建構各行業應用平台層,讓各產業能無縫對接HPC所提供的「算力」,加速實現數位轉型。

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GARAOTUS攜手偉薩科技、研華科技及英特爾,提供印度醫療機構MedGenome基因組分析整體解決方案,大幅提昇其在罕見疾病及帕金森氏症89%的運算效能。

本文章內容由「精誠資訊」提供,經關鍵評論網媒體集團廣編企劃編審。

專題下則文章:

GARAOTUS首席策略長張祐誠:扭轉高速運算(High-Performance Computing, HPC)基因,讓「算力」成為產業轉型的新能源


GARAOTUS 台灣AI-HPC 技術領導品牌站穩亞太區十強的關鍵報導:

在AI-HPC及雲端技術逐漸被討論之際,GARAOTUS這個已成功完成三座Top 500且具成熟的技術團隊,2020獲選亞洲前十大HPC技術團隊殊榮,並於2021年獲IIA頒發最佳服務及解決方案獎項,其整合AI及HPC的產品-CRONUS,提供結合HPC科學運算的驚人算力,瞄準全球市場大餅,與國際大廠攜手打國際盃背後的精彩故事。

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